新疆自治区高院伊犁分院是新疆高院派驻伊犁州的审判机关，兼具中级法院全部审判职能，高级法院一部分职能，管辖范围覆盖伊犁州11个直管县市，还管辖塔城、阿勒泰两个地区中级法院，24个县市基层法院，23个基层法庭。
对其一审判决上诉，由新疆高院审理。
死刑案件二审与复核由新疆高院管辖。
设立旅游巡回法庭、科技法庭，在4A级景区建立9个科技法庭，实现远程作证、庭审音像记录共享 。建成19个“枫桥式”中心法庭、7个巡回法庭、332个法官工作站（巡回审判点）、15个旅游景区法庭，服务延伸至田间地头、牧区毡房。
