武警海警学院历经武警部队成立初期创建、公安序列、升格本科、重回武警序列四个阶段。


初创于武警时期（1982-1993）
 1982年3月：国务院批准组建海巡训练大队。1983年9月：大队改建为 人民武装警察部队水面船艇学校，是由公安部下属的武警总部直接管理。1985年9月：正式开学，暂由武警浙江总队代管，执行副师级权限{同正处级中专学校}。

公安序列时期（1993-2010）
 1993年9月：转隶公安部边防部队，更名为 公安边防水面船艇学校。1999年3月：升格为 公安海警高等专科学校，实施专科教育。2010年3月：经教育部批准升格为 公安海警学院（本科），级别由正师升至副军级。


武警海警学院时期（2018-至今）
2018年6月30日：根据机构改革方案，整体转隶武警部队，更名为 中国人民武装警察部队海警学院。2020年7月1日：正式按新编制体制运行。